Constitué en association, le Fonds est administré par un Conseil d’administration réunissant des représentants de l’État, des organisations syndicales de salariés et d’employeurs, des associations de collectivités territoriales, des parlementaires, des comités locaux et autres organismes publics impliqués dans le dispositif.

Il est présidé par Louis Gallois, avec le soutien en tant que vice-président de Michel de Virville.
Il est dirigé par Patrick Valentin.

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